Szerző dc.contributor.author | Nyerges, A | |
Szerző dc.contributor.author | Csorgo, B | |
Szerző dc.contributor.author | Draskovits, G | |
Szerző dc.contributor.author | Kintses, B | |
Szerző dc.contributor.author | Szili, P | |
Szerző dc.contributor.author | Ferenc, G | |
Szerző dc.contributor.author | Revesz, T | |
Szerző dc.contributor.author | Ari, E | |
Szerző dc.contributor.author | Nagy, I | |
Szerző dc.contributor.author | Balint, B | |
Elérhetőség dátuma dc.date.accessioned | 2022-12-23T13:24:34Z | |
Rendelkezésre állás dátuma dc.date.available | 2022-12-23T13:24:34Z | |
Kiadás dc.date.issued | 2018 | |
Uri dc.identifier.uri | http://hdl.handle.net/10831/67200 | |
Kivonat dc.description.abstract | Antibiotic development is frequently plagued by the rapid emergence of drug resistance. However, assessing the risk of resistance development in the preclinical stage is difficult. Standard laboratory evolution approaches explore only a small fraction of the sequence space and fail to identify exceedingly rare resistance mutations and combinations thereof. Therefore, new rapid and exhaustive methods are needed to accurately assess the potential of resistance evolution and uncover the underlying mutational mechanisms. Here, we introduce directed evolution with random genomic mutations (DIvERGE), a method that allows an up to million-fold increase in mutation rate along the full lengths of multiple predefined loci in a range of bacterial species. In a single day, DIvERGE generated specific mutation combinations, yielding clinically significant resistance against trimethoprim and ciprofloxacin. Many of these mutations have remained previously undetected or provide resistance in a species-specific manner. These results indicate pathogen-specific resistance mechanisms and the necessity of future narrow-spectrum antibacterial treatments. In contrast to prior claims, we detected the rapid emergence of resistance against gepotidacin, a novel antibiotic currently in clinical trials. Based on these properties, DIvERGE could be applicable to identify less resistance-prone antibiotics at an early stage of drug development. Finally, we discuss potential future applications of DIvERGE in synthetic and evolutionary biology. | |
Nyelv dc.language | Angol | |
Cím dc.title | Directed evolution of multiple genomic loci allows the prediction of antibiotic resistance. | |
Típus dc.type | folyóiratcikk | |
Változtatás dátuma dc.date.updated | 2022-05-16T13:46:47Z | |
Megjegyzés dc.description.note | COIS Conflict of interest statement: A.N., B.C., B.K., and C.P. have filed a patent : application toward the European Patent Office. I.N., B.B., B.M.V., and P.B. had : consulting positions at SeqOmics Biotechnology Ltd. at the time the study was : conceived. SeqOmics Biotechnology Ltd. was not directly involved in the design : and execution of the experiments or in the writing of the manuscript. Hiányzó szerző: 'http' Synthetic and Systems Biology Unit, Institute of Biochemistry, Biological Research Centre of the Hungarian Academy of Sciences, Szeged, 6726, Hungary Doctoral School in Biology, Faculty of Science and Informatics, University of Szeged, Szeged, 6720, Hungary Nucleic Acid Synthesis Laboratory, Institute of Plant Biology, Biological Research Centre of the Hungarian Academy of Sciences, Szeged, 6726, Hungary Department of Genetics, Eötvös Loránd University, Budapest, 1053, Hungary Sequencing Laboratory, SeqOmics Biotechnology Ltd., Mórahalom, 6782, Hungary Sequencing Platform, Institute of Biochemistry, Biological Research Centre of the Hungarian, Academy of Sciences, Szeged, 6726, Hungary Department of Microbiology and Immunology, University of California, San Francisco, CA 94143 Synthetic and Systems Biology Unit, Institute of Biochemistry, Biological Research Centre of the Hungarian, Academy of Sciences, Szeged, 6726, Hungary Cited By :20 Export Date: 8 December 2020 CODEN: PNASA Correspondence Address: Nyerges, Á.; Synthetic and Systems Biology Unit, Institute of Biochemistry, Biological Research Centre of the Hungarian Academy of SciencesHungary; email: nyerges.akos@brc.mta.hu | |
Terjedelem dc.format.page | E5726-E5735 | |
Doi azonosító dc.identifier.doi | 10.1073/pnas.1801646115 | |
Wos azonosító dc.identifier.wos | 000435585200014 | |
Scopus azonosító dc.identifier.scopus | 85048759960 | |
Mtmt azonosító dc.identifier.mtmt | 3390047 | |
Füzetszám dc.identifier.issue | 25 | |
Folyóiratcím rövidítve dc.identifier.jabbrev | P NATL ACAD SCI USA | |
Folyóirat dc.identifier.jtitle | PROCEEDINGS OF THE NATIONAL ACADEMY OF SCIENCES OF THE UNITED STATES OF AMERICA | |
Kötetszám dc.identifier.volume | 115 | |
Kiadás éve dc.description.issuedate | 2018 | |
Pubmed azonosító dc.identifier.pubmed | 29871954 | |
Szerző szervezeti egysége dc.contributor.institution | Biokémiai Tanszék | |
Szerző szervezeti egysége dc.contributor.institution | Lendület Számítógépes Rendszerbiológiai Kutatócsoport | |
Szerző szervezeti egysége dc.contributor.institution | MTA-ELTE Molekuláris Biofizikai Kutatócsoport | |
Szerző szervezeti egysége dc.contributor.institution | Virológiai Kutatócsoport | |
Szerző szervezeti egysége dc.contributor.institution | Genetikai Tanszék | |
Szerző szervezeti egysége dc.contributor.institution | MTA Szegedi Biológiai Kutatóközpont | |
Szerző szervezeti egysége dc.contributor.institution | Gyermekgyógyászati Klinika és Gyermek Egészségügyi Központ | |
Szerző szervezeti egysége dc.contributor.institution | Biofizikai Intézet | |
Szerző szervezeti egysége dc.contributor.institution | Biokémiai Intézet | |
Szerző szervezeti egysége dc.contributor.institution | Lendület Szintetikus és Rendszerbiológiai Kutatócsoport | |
Szerző intézménye dc.contributor.department | Biokémiai Intézet | |
Szerző intézménye dc.contributor.department | Biokémiai Intézet | |
Szerző intézménye dc.contributor.department | Biokémiai Intézet | |
Szerző intézménye dc.contributor.department | Biokémiai Intézet | |
Szerző intézménye dc.contributor.department | Biokémiai Intézet | |
Szerző intézménye dc.contributor.department | Növénybiológiai Intézet | |
Szerző intézménye dc.contributor.department | Biokémiai Intézet | |
Szerző intézménye dc.contributor.department | Biokémiai Intézet | |
Szerző intézménye dc.contributor.department | Genetikai Tanszék | |
Szerző intézménye dc.contributor.department | Biokémiai Intézet |
A tételhez tartozó fájlok
Ez a tétel a következő gyűjteményekben található meg
-
Tudományos publikációk (TTK) [3593]